La acción empieza tras los dos años y medio que el protagonista, Naruto Uzumaki, ha pasado entrenando con su maestro Jiraiya. En ella reaparecen todos los personajes de la anterior serie pero con más experiencia y fuerza. Además, la Organización Akatsuki entra definitivamente en acción, tras su breve aparición en la parte anterior, y se revelan sus objetivos. El enemigo principal de la parte anterior de Naruto, Orochimaru, ha estado mientras tanto entrenando a Sasuke Uchiha, antiguo compañero de Naruto, que abandonó voluntariamente la aldea para ganar fuerza gracias a este personaje, y así poder tomar venganza contra su hermano, Itachi Uchiha.

Tras rescatar a Last Order y recibir un disparo en la cabeza, el esper más poderoso de toda Ciudad Academia descansa en el hospital para recuperarse... aunque no por mucho tiempo, puesto que una misteriosa chica con una foto de su pequeña protegida aparece para pedirle ayuda. Cuando Accelerator descubre que Last Order esta en peligro, no tarda en ponerse en marcha de nuevo para protegerla a ella, la ciudad, ¡e incluso el mundo entero.

Durante el segundo año de Koyomi Araragi en la Escuela Secundaria Privada de Naoetsu, tiene un encuentro casual con Tsubasa Hanekawa, el mejor estudiante de honor de su clase. Cuando inician una conversación, Hanekawa menciona un rumor impactante: se ha visto a un vampiro con un hermoso cabello rubio y ojos helados merodeando por la ciudad. Feliz de haber hecho un nuevo amigo, Araragi anula el rumor y recorre el resto de su velada de manera despreocupada. Sin embargo, en su camino a casa, tropieza con salpicaduras de sangre que bajan las escaleras hacia el metro. Su curiosidad lo empuja a seguir investigando, por lo que sigue las piscinas horripilantes hacia las profundidades de la estación.

Waver Velvet, el joven que lucho codo con codo con Iskandar durante la Cuarta Guerra del Santo Grial de Fate/Zero. El tiempo ha pasado y ahora Waver, mas maduro, ha adoptado el nombre de Lord El-Melloi. Como El-Melloi II, enfrenta todo tipo de casos mágicos y misticos en la Torre del Reloj, la meca de todos los magos.

La historia nos pone en la piel del Conde Vlad Dracula Tepes, un poderoso vampiro que promete exterminar a toda la gente de Wallachia en el término de un año, debido a que su esposa fue quemada en la hoguera y falsamente acusada de realizar brujería por las mismas personas del lugar. Es así que pasado el año, las hordas de monstruos y demonios comandados por Dracula empiezan a arrasar el pueblo, logrando que las personas vivan con temor y desconfianza. En la vereda de enfrente se encuentra Trevor Belmont, último miembro de la familia Belmont, un famoso clan dedicado a cazar todo tipo de demonios y monstruos, especialmente vampiros. Él se alzará en armas contra Dracula, pero no estará solo, ya que lo acompañan en esta tarea Sypha Belnades, una poderosa maga y Adrian Alucard Tepes. Juntos tratarán de impedir que la raza humana sea aniquilada. La serie está basada en el videojuego Castlevania III: Dracula's Curse y se ambienta en el siglo XV.

La nueva serie continúa los motivos conceptuales de la canción, la danza y la moda de Pretty Series, y también agrega el tema de la magia. Matsuri Hinoya, estudiante de primer año de secundaria, ama los festivales y sueña con poder protagonizar "PriMagi", una forma mágica de entretenimiento escénico que nace de la canción, el baile y la moda. Ese día llega cuando Myamu, el mago hiperactivo y problemático, llega del reino mágico y explora a Matsuri en busca de PriMagi. Juntos, los dos compiten con rivales para llegar a la cima de PriMagi.