Un joven sin mucha autoestima llamado Haruyuki recibe de Kuroyukihime, una hermosa senpai, una aplicación para su NeuroLink llamada Brain Burst, que le permite, al ejecutarla, "acelerar"; sus procesos de pensamiento. Sin embargo, el Brain Burst es además un juego de peleas multiplayer, donde otros poseedores del programa luchan entre sí para obtener Burst Points, necesarios para poder acelerar.

El estudiante de segundo año de secundaria, Yatora Yaguchi, está aburrido de su vida normal. Estudia bien y juega con sus amigos, pero la verdad es que no disfruta de ninguna de esas actividades. Atado por normas, envidia secretamente a quienes hacen las cosas de manera diferente. Eso es hasta que descubre la alegría de dibujar. Cuando ve una pintura hecha por un miembro del Art Club, Yatora queda fascinado con los colores utilizados en ella. Posteriormente, en un ejercicio de arte, intenta transmitir su lenguaje sin palabras sino a través de la pintura. Después de esa experiencia, Yatora se encuentra tan involucrado en el arte que decide que es lo que quiere hacer para ganarse la vida. Pero existen múltiples obstáculos en su camino: sus padres que dudan sobre sus elecciones únicas, sus compañeros más experimentados y el estudio de un tema mucho más profundo de lo que inicialmente esperaba.

Se entrega una carta a Lord El-Melloi II informándole de una reunión de Clock Tower. Una mañana, cuando se acerca la fecha de la reunión , Lord El-Melloi II se mira al espejo y se tambalea en estado de shock. ¡De repente es una década más joven! Lord El-Melloi II se ha convertido en Waver Velvet, ¡su antiguo yo! Lord El-Melloi II se siente atrapado por una poderosa ilusión inducida por arte de magia y comienza a investigar de inmediato cómo pudo haber sucedido. El día del reencuentro, se dirige a la reunión de sus contemporáneos, planea enfrentar a quien haya transformado su cuerpo y con la esperanza de revelar sus intenciones. Sin embargo, cuando llega Touko Aozaki, las cosas dan un giro repentino...

La historia se centra en Monona, una chica que va a la boda de su onii-chan, al que adora. Sin embargo, es llevada por una jewelpet (una coneja) llamada Ruby y antes de darse cuenta, está en el Jewel Palace donde se han reunido candidatas potenciales a ser Lady Jewelpet.

Kanna pierde las ganas de correr profesionalmente tras la muerte de su madre. Con la ayuda de un conejo de una oreja mensajero de los dioses, y de Yato, un joven Oni, empezará un viaje personal con tintes mágicos.